MIMI
Het grote genoom van het mimivirus stelt het in staat zijn eigen eiwitten aan te maken
News
Published online: 14 October 2004; | doi:10.1038/
Giant virus qualifies as 'living organism'
Mark Peplow
http://www.nature.com/news/2004/041011/ ... 11-14.html
De complexe inhoud van een mimivirus : vergroting 200,000 X (rood gekleurd ).
© Didier Raoult, : beeld N. Aldrovandi
Het genoom van het grootste virus ter wereld is ontrafeld :___ het virus kreeg het lab-koosnaampje "Mimi" :
" : Officieel is mimi de afkorting voor "mimicking microbe."
zegt onderzoeker Didier Raoult.
"... maar mijn vader , ook een wetenschapper , vertelde me ooit het zelfsverzonnen sprookje voor het slapengaan over "mimi l'amoebe'
De naam is ook ter zijner nagedachtenis ... "____
In een zopas verschenen artikel in science ( 1 ), zeggen de Franse wetenschappers die het onderzoek deden dat
"Mimi, in tegenstelling tot andere virussen , wel degelijk "echt" levend is ... "
Het virus genoom lijkt ook de sleutels te bevatten die de evolutie die leide tot de eerste "cellen met DNA-nucleus" , kunnen verklaren
Sinds de 60-tiger jaren van vorige eeuw argumenteren wetenschappers over de vraag of " virussen levende organismen zijn, of een bundel grote biochemische moleculen op basis van C/N ...chemie "
Virussen ( micro agens die niet door de bacteriefilters kunnen worden uitgezift ) zijn gewoonlijk kleiner en simpeler dan de bacteria zijn lange tijd beschouwd als "naakte genen " ;maar ze bestaan eigenlijk uit toch wat meer : enkel wat genetisch materiaal , omhuld door een eiwitlaagje ( capsule/coat )
Een virus MOET de biologische replikatie machinerie van een " echt levend " orgnanisme kapen ; het doet dat door zijn genetisch materiaal in de gastcel te injekteren
Bakteria , in kontrast met de virussen , bezitten en onderhouden alle noodzakelijke inrichtingen / programma's en informatie om zich zelfstandig
te vermenigvuldigen : ze zijn dan ook per definitie "levend " .
" Alhoewel het alle kenmerken van een virus heeft , is het mimi-virus ; complexer dan de doorsnee virus "
zegt Jean-Michel Claverie, bioloog aan het Institut de Biologie Structurale et Microbiologie , Marseilles, France , __ en lid van het team dat de
sequencing inspanning deed ....
" ... Als men zich virussen voorstelt als het automerken-modellen aanbod op de markt ; dan is MIMI een auto , maar dan wel een luxe-model en uitgerust met de meeste
acessoires en de verst gevorderde technologieen en snufjes ...
" het Mimi DNA -virus lijkt op een nieuwe vorm van parasitair leven "
Mimi draagt 50 genen ( van de 1260( ? ) aanwezige ) waarvan nu al zeker is geweten dat die dingen doen , nog nooit eerder gezien in een virus .
Het bestudeerde Mimivirus kan ongeveer 150 eiwitten zelf aanmaken samen met de nodige chemische " chaperonnes "om de juiste "opvouwprocedures " te gebruiken bij de stereochemische opbouw van die proteinen ....
Het kan zelfs het eigen DNA repareren wanneer dat beschadigd word ,
en dat allemaal in tegenstelling tot andere " normalere " virussen
--------------------------------------------------------------------------------
Ter Vergelijking ;
Het "kleinste "tot nu toe gekende bacterieel genoom ( en kleinste organisme in staat tot zelfstandige replicatie )
Mycoplasma genitalium ---->
http://www.er.doe.gov/Sub/Accomplishmen ... ry/77.html
" ..... When the entire 580,000-unit DNA sequence was completed, this free-living microbe was discovered to have only 470 genes that code for
proteins.... )
http://www.tigr.org/tigr-scripts/CMR2/G ... tabase=gmg
http://www.tigr.org/CMR2/images/splash_circle_303.gif
Below is a schematic representation of the Mycoplasma genitalium G-37 chromosome.
Choose a DNA molecule from the Select DNA Molecule menu below to get a larger, more detailed view.
interactieve Genetische kaart van
Mycoplasma genitalium G-37
--------------------------------------------------------------------------------
Virussen gebruiken ofwel DNA ofwel RNA ( retro-virussen ) om hun informatie vast te houden en te gebruiken als "smetstof" ;
mimi bezit en gebruikt
beiden ...
" we hebben hier een echt organisme, Er is DNA , RNA en een grote hoeveelheid eiwitten aanwezig " zegt Didier Raoult,een leidend lid van het team ...
Monster virus
Mimi werd ontdekt in 1992 door de Britse microbioloog Tom Rowbotham tijdens een onderzoek naar amoeba levend in het water van een koeltoren te
Bradford( engeland ) , waarvan werd vermoed dat het de bron was van een influenza uitbarsting in de wijde omgeving ....
Amoeba leven in koelwater en in air-conditioning systemen , ze voeden zich met "kiemen" waaronder pathogenen als Legionella en Chlamydia pneumoniae
Deze laatste kan ademhalingsziekten veroorzaken
Raoult ontdekte dat sommige pneumonia patienten antistoffen bezaten tegen het MIMI -virus ...
Opvolgings- onderzoek
toonde aan dat het hier ging om een echt viraal " monster" van 800 nanometer doorsnede , ongeveer viermaal zo groot als het pokken virus ...
De nieuwe studie toont aan dat het genoom bestaat uit 1.2 millioen bases-opeenvolgingen : dat is meer dan wat in sommige bacterieen aanwezig is
en maakt het verscheidene keren groter dan de grootste DNA virussen ....
De nucleotide -basen zijn gewonden tot 1,260 genen( een enorm aantal voor een virus) ,waardoor het virus even complex wordt als sommmige bacteria
Het virus is zo groot dat de eerste onderzoekers dachten met een bacterie te doen te hebben ...
De meeste virussen zijn slechts zichtbaar met elektronen -microscopen , maar dit virus kon worden ontdekt met een hoogwaardig optisch microscoop
Didier Raoult ( Marseille) kon geen specifieke bacterie genen detekteren ....
.
Het team vergeleek het met andere grote virussen zoals het pokken virus waarmee het "misschien " verwant is .
Het virus vormde de eerste van een volledig nieuw "ontdekte" ( lees --> speciaal benoemde ) virus familie : de
Mimiviridae
Dat dient echter nog verder te worden bevestigd ...
http://www.cbc.ca/stories/2003/03/28/virus_giant030328
De oude theorie dat virussen waarschijnlijk " gedegenereerde " bacterieen zijn , komt hiermee echter verder op de helling te staan ...
zeker wanneer men in rekening brengt dat veel virussen ook "nieuwe" ( non-bacterieele ) genen bevatten ( wat dan weer werd verklaard door het
idee dat de stamouders van die degenerees ondertussen "uitgestorven " waren ... )
Bovendien , bevat viraal DNA dikwijls erg veel "junk" en "onzin" sequencen , genetisch materiaal zonder enige nuttige functie (ballast ? )
Mimi, echter is erg proper erg gemeen er erg efficient en erg succesvol ; meer dan 90 n 90% van zijn DNA doet iets specifieks .
Omdat Mimi , genen bevat die iets te maken hebben met replicatie , is dit misschien de reden van zijn groter verspreiding-succes , zegt
Anne Bridgen, virologiste van de University of Ulster, Northern Ireland.
"Ik heb nog nooit van virussen gehoord die coderen zoals dit ding doet "
zei ze
Levenslijnen
Alhoewel biologen het levende soms verdelen in drie aparte categorieen ( zie Carl Woese ) is er genoeg materiaal over Mimi om
een vierde tak van
fundamenteel leven aan de basis van de levensboom toe te voegen ...
---> Bacteria zijn de primitiefste tak omdat ze een "echte " kern missen ( wél een chromosoom ) om hun genetische basisinfo te bewaren
---> Archaea loijken daar erg op , maar lijken apart geevolueerd , omdat ze een ander soort ongebruikelijk celmembraan bezitten
.
---> Alle andere levende dingen zijn eukaryoten ; in het bezit van cellen ( of één cel ) met een kern
Mimi bezit zeven genen die gemeenschappelijk zijn in alle leven , waardoor het bewijst verwant te zijn aan alle andere levensvormen
zegt Raoult en als .... "echt" leven kan worden bestempeld .
Bridgen draait ( voorzichtig ? ) meer rond de pot ;
"zeggen dat dit virus de vertegenwoordiger is van een vierde categorie van leven , is een overhaaste conclusie maar het kan misschien wel suggerene dat een drie kategorieen -systeem wel wat simplistisch is ... " ,
"
LIVING TRANSITIONNAL" of " ENDOSYMBIONTE PARTNER " ?
Enkele wetenschappers hebben geopperd dat
eukaryoten oorspronkelijk onstonden uit de endosymbiotische samensmelting van een virus en een bacterie§ of meerdere bacterieen ...
Bacteria kunnen de ribosomen hebben geleverd ( de proteine-fabrieken van de cell ) en de virussen zouden hun materiaal hebben geinjecteerd in
endosymbionte cellen bestaande uit een samenwerking tussen verschillende bacterieen , waardoor ze eigenlijk een proto-kern vormden ...
Een veel gehoord bezwaar tegen deze hypothese is dat virussen over het algemeen de sleutel-genen van de eukaryoten missen ...
Maar het mimi genoom bezit ze wel , waardoor dus ondersteuning van de theorie weer mogelijk wordt ... zegt Raoult.
Het team probeert nu andere reuze virussen op te sporen ,
en zijn ook druk bezig mry exact uit te zoeken hoe en waar en waarvoor ,
Mimi het aanwezige genen-kapitaal allemaal gebruikt ....
Referenties
(1) Raoult D., et al. Science, published online, doi:10.1126/science.1101485 (2004).
(2) La Scola B., et al. Science, 299. 2033 (2003).
, vanavond, morgen of later deze week.